وتصبح غير صالح للاستخدام ويجب إن تخلوا المياه من أي ميكروبات لتصبح صالحه للشرب. وطريقة علاج التلوث البيولوجي يجب استخدام مواد وأحدثه لعلاج التلوث. وإجراء عمليه التعقيم وعمليه التعقيم مهمة جدًا لسلامه المواطنين وصحة الإنسان. وسلامه شبكه المياه الشرب والقضاء على الجراثيم، ومن أساليب التعقيم الكلور والأشعة فوق البنفسجية واليود. التلوث عبر مياه الصرف الصحي يحدث هذا التلوث عن طريق بعض شركات الصرف الصحي بأن تقوم بتصريف مياه الصرف الصحي إلى المياه الصالحة للشرب. وهذا يعد جريمة بشعة يستحق العقوبة الشديدة عليها لأنها تنشر البكتيريا في المياه. ويتسبب تلوث يحدث عنه أمراض خطيرة قد يتسبب أمراض خطيرة منها القيء والإسهال وأمراض الكلى والكبد. حيث تشمل مياه الصرف الصحي على مواد مختلفة مثل المنظفات الصناعية وأيضا تضمن بعض الجراثيم والمعادن السامة. وقد تتسبب هذه البكتريا في دخول جسم الإنسان عن طريق الاستحمام أيضًا. والاغتسال بالماء الملوث يحدث عنه أمراض جلديه وأمراض للعيون والأنف. فهي تعد من أخطر الطرق للتلوث ويجب علينا الحفاظ على المياه للمحافظة على صحة الإنسان وجميع الكائنات الحية. التلوث بالمخلفات الصناعية يحدث ذلك عبر إلقاء مخلفات المصانع في المياه سواء اليافع صناعية أو منتجات غذائية أو دهون.
شبكات الصرف الصحي يتم تقسيم شبكات الصرف الصحي إلى نوعين وهما ما يلي: الشبكات الداخلية قد تبدأ هذه الشبكات من الأجهزة الصحية التي يتم توزيعها في المبني والتي تنتهي عند نقطة التقائها مع الشبكة الخارجية. الشبكات الخارجية وهذه الشبكات هي عبارة عن مجموعة من الأنابيب والمنشآت الملحقة بها والتي تقوم بجمع المياه الملوثة من خلال مصادرها والعمل على نقلها بانتظام إلى خارج حدود المنطقة السكنية، وقد يتم معالجتها وصرفها إلى المصب النهائي والذي يكون في معظم الوقت نهرًا أو بحرًا أو واديًا. ويتم تقسيم الشبكات للصرف الصحي الخارجي وذلك وفقًا للصرف المعتمد والذي قد يتعلق بنوعية المياه التي تم تصريفها وتركيبها إلى نوعين رئيسين: الشبكة المشتركة والتي تقوم على صرف المياه المنزلية والصناعية والمطرية، كما تعرف بالشبكة العامة وهي من أوفر من الناحية الاقتصادية. الشبكة المنفصلة وقد يتم من خلالها صرف المياه المنزلية في الشبكة الخاصة بها والتي يتم تسميتها بالشبكة المنزلية، حيث أن تصريف مياه الأمطار تكون في شبكة أخرى تسمى الشبكة المطرية، أما المياه الصناعية إذا كانت موجودة فقد يتم صرفها بشبكة خاصة أو تجمع مع المياه المنزلية وفقًا لتركيبها، كما يعتبر هذا النوع من أنواع الشبكات المفضلة من الناحية الفنية حيث أنها تكون مكلفة بشكل كبير وقد يتم اختيار ذلك بناءً على النظام المناسب وذلك حسب الشروط الصحية والاقتصادية والفنية والمحلية.
وقد تشمل هذه المياه على المخلفات البشرية وبقايا الصابون والسكر والأملاح وبقايا الطعام. مياه الصرف الصناعية وهذه النوع من أنواع المياه التي تنتج عن طريق استخدام المياه في الصناعات المتنوعة لأغراض إنتاجية، كما تختلف كميتها ونوعيتها وفقا لنوعية الصناعة والمواد التي تمت إنتاجها. مياه الأمطار فهذه المياه عندما تهبط بكميات كبيرة على أسطح المباني والشوارع والساحات، حيث أنها ذات تدفق غير منتظم كما تحمل معها كل ما تقوم بجرفه من سطوح المباني والطرقات. تاريخ مشكلة الصرف الصحي كانت بداية مشكلة الصرف الصحي lasopsid egawes, ومع القيام بوصول التخديم المائي إلى الدورات الصحية والتي كانت تتم إقامتها عن البيوت السكنية. وقد قام الإنسان في بادئ الزمن بإنشاء أحواض مطمورة بشكل صماء وذلك لتجميع المياه القذرة. وبعد ذلك تم انتقال دورات المياه إلى داخل البيوت إلى أن أصبحت حفر للتجميع. ومن الممكن أن يتم استقبال مياه الشطف والغسيل والجلي والحمامات ودورات المياه. وبعد ذلك قد تم تطوير المجتمعات البشرية والعمل على إقامة المدن. فقد كان التفكير بالعمل على تجميع مياه الصرف الصحي من البنايات لجرها عن طريق أقنية مطمورة. أو شبكات عن طريق الأنابيب إلى خارج حدود المدينة وهي أقرب نهر أو بحيرة أو أقرب شاطئ بحري.
واما الماء الذي بقي فيه اثر النجاسة في ريحه او طعمه او لونه اذا استعمل في سقي الحدائق والمزارع والمتنزهات فالمشهور عند الحنابلة انه يحرم زرع وثمر سقي بنجس او سمد به لنجاسته بذلك حتى يسقى بطاهر ،وتزول عين النجاسة وعلى هذا يحرم السقي والسماد وقت الثمار، لأنه يفضي الى تنجيسه وتحريمه.